Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPBAR1Q8TDU6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPBAR1Q8TDU6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms