Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms