Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms