Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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