Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP31Q70CQ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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