Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMBR1LQ6UX01 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms