Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms