Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPPQ6IPU0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms