Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF6Q5VXH4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF6Q5VXH4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms