Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BROXQ5VW32 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms