Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q5VSD8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms