Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RSPH4AQ5TD94 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms