Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf220Q5T0J3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms