Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms