Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C5orf47Q569G3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms