Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms