Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms