Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF9Q3BBW0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms