Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PROX2Q3B8N5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PROX2Q3B8N5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms