Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSPP1Q1MSJ5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms