Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MSMPQ1L6U9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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