Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN1Q16799 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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