Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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E2F4Q16254 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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E2F4Q16254 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F4Q16254 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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