Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC6Q16204 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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