Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZNF56Q15929 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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