Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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TRIP10Q15642 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms