Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKIV2LQ15477 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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