Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EEA1Q15075 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
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