Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3GAP1Q15042 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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