Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAM2Q15035 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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