Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERC3Q15034 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms