Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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