Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM28Q13263 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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