Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME3Q13232 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME3Q13232 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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