Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms