Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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