Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC15Q0P6D6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC15Q0P6D6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms