Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPAL4Q0D2K0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPAL4Q0D2K0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms