Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms