Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms