Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEUP1Q05D60 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms