Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ID3Q02535 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ID3Q02535 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ID3Q02535 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ID3Q02535 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ID3Q02535 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ID3Q02535 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms