Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms