Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5Q00535 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms