Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms