Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVPABLB-1P60509 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms