Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms