Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSX2P58304 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms