Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms