Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNU13P55769 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNU13P55769 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNU13P55769 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNU13P55769 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNU13P55769 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNU13P55769 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNU13P55769 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNU13P55769 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms